Научно-исследовательская работа кафедра проводится по нескольким направлениям. Основным научным направлением является исследование факторов риска, клинических особенностей, диагностики, лечения, профилактики  заболеваний органов пищеварения и коморбидных состояний. Эти проблемы освещены в  изданных сотрудниками 14 монографиях по проблемам гастроэнтерологии и коморбидных состояний, в национальных рекомендациях, изданных с участием зав. кафедрой профессиональными сообществами, в  учебных пособиях, изданных сотрудниками кафедры. Результаты научных исследований кафедрального коллектива опубликованы в ведущих медицинских журналах в России и за рубежом, а также в журналах, которые индексируются в системах SCOPUS, WEB OF SCIENCE, PUB MED.  

Одной из форм внедрения результатов исследования в практику органов здравоохранения стали патенты на изобретения и полезные модели. Сотрудники кафедры имеют 12 патентов на изобретения  и полезные модели,  4 свидетельства на регистрации баз данных.

        Под руководством и при активном участии коллектива кафедры на базе ФГБОУ ВО «Саратовского государственного медицинского университета им.В.И. Разумовского» МЗ РФ ежегодно проходят межрегиональные  и областные научно-практические конференции, посвященные различным аспектам гастроэнтерологии и коморбидным состояниям. Сотрудники кафедры выступают с докладами в Москве, Санкт-Петербурге, Самаре и других городах, принимают участие в международных конгрессах.

        Напряду с изучением патологии органов пищеварения у коморбидных пациентов проводятся исследования болезней органов дыхания и кровообращения. Под руководством д.м.н. профессоров Т.Г. Шаповаловой были защищены 3 кандидатские диссертации по проблемам патологии органов дыхания и коморбидным состояниям. В настоящее время  сотрудники кафедры участвуют в создании Национального Регистра пациентов с идиопатическим легочным фиброзом.

Подготовка научных кадров на кафедре медицинского вуза начинается со студенческой скамьи и продолжается в ординатуре и аспирантуре. В научном студенческом кружке кафедры (СНК), в котором занимаются студенты лечебного, педиатрического и медико-профилактического факультетов. Работой СНК кафедры руководит ассистент, к.м.н. Т.А. Тихонова.

Члены кружка неоднократно становились победителями и дипломантами форумов молодых ученых различного уровня. Студенческие  работы в соавторстве с преподавателями опубликованы в изданиях, рекомендованных ВАК РФ.

На заседаниях кружка проводятся мастер-классы профессоров кафедры, посвященные новейшим клиническим рекомендациям, сложным и интересным вопросам терапии, проблемам коморбидных пациентов, что позволяет кружковцам приобрести новые знания, выходящие за рамки учебной программы. Преподаватели кафедры проводят деловые игры, разбирают сложные клинические случаи. Помимо научной и образовательной составляющих, работа в СНК расширяет кругозор учащихся. Студенты готовят сообщения по проблемам истории, геральдики медицины, международных медицинских организаций. Доброй традицией стада веселая литературно-музыкальная «Игра в диагноз» в преддверии Нового года. Неизменным успехом у членов кружка пользуются фильмы о жизни, судьбе, научной деятельности знаменитых врачей: наших предков и современников.

Активная дискуссия, обсуждение концепций диагностики, тактики ведения пациентов формируют у учащихся основы клинического мышления, умение принимать обоснованные решения в конкретных клинических ситуациях. 

В период 2017-2021 65 студентов выступили с докладами на конгрессах и конференциях разного уровня,  завоевали 18 призовых мест, 23 ординатора, из которых 8 стали победителями олимпиад и конкурсов различного уровня, совместно с обучающимися опубликована 51 печатная работа, из которых -18 в журналах из списка ВАК РФ, 2 статьи в журналах из базы SCOPUS.

Летом 2021 студенты -кружковцы приняли участие в Первой летней школе по гастроэнтерологии, организованная Институтом международного образования Харбинского медицинского университета

В студенческом научном кружке кафедры, в школе мастерства «Современная гастроэнтерология» идет активная подготовка будущих талантливых педагогов, врачей, ученых для вузов и клиник Российской Федерации.